嬰兒手足口病的早期初期癥狀，可能表現為吞咽困難、不愛喝水、不愛吃飯，在吞咽的時候，可能會表現出比較痛苦的表情。另外有些嬰兒可能會出現早期低熱的現象，可能有鼻塞、流涕等感冒癥狀。通常手足口病的早期的癥狀并不典型，如果進入手足口病的癥狀出現時，主要表現為發熱，同時伴有咽喉部的皰疹、手部和足部的皰疹。另外也有些嬰兒可能會在臀部，或者下肢部出現皰疹的存在，這是比較典型的手足口癥狀。如果病合并腦炎、嚴重的心肌炎、肺炎等，除了發熱、皰疹等癥狀以外，還可能會伴有心慌、胸悶、呼吸困難、咳喘等表現。如果是比較輕癥的手足口病，皮疹可能單純是皰疹的表現，可以不出現發熱等癥狀。所以嬰兒的手足口病相對而言癥狀有時并不典型，需要醫生及時觀察之后進行確診。