在臨床上，注射用糜蛋白酶有多種應用，該藥物適用于創傷或手術后的傷口愈合，以及局部水腫的抗炎治療。另外也可以用于慢性支氣管炎、氣管炎及肺膿腫的擴張，對膿性或非膿性痰液的排出有一定的療效。此外還可以用于眼科手術中，如松弛睫狀韌帶等。注射用糜蛋白酶的使用，必須在醫生的指導下進行。在經過醫生規范的診療以后，并明確上述適應證的前提下，才可以按醫生的處方指導應用。作為藥用，此藥應確保使用一定的劑量并持續一定的時間以后，才會產生療效。作為患者，要按醫生的指導用藥。在治療過程中，出現不良反應或其他癥狀，應及時向醫生、藥師或護士反映，以便根據治療情況，明確原因，并進行用藥調整、劑量調整或其他規范的處理。