病毒性結膜炎和細菌性結膜炎的常見區別如下所示：1、感染微生物不同：病毒性結膜炎是由病毒感染造成，細菌性結膜炎由細菌感染所致；2、臨床表現不同：病毒性結膜炎表現為眼紅、怕光、流淚，分泌物類似水、漿液狀。細菌性結膜炎分泌物是黏液膿性，如同病毒性感冒會流清鼻涕，細菌性感冒流膿鼻涕；3、病程不同：病毒性結膜炎病程較長且遷延不愈，藥物治療后效果欠佳。細菌性結膜炎病程較短，經過抗菌素治療后可較快好轉；4、預后不同：病毒性結膜炎預后較差，因為病程長、炎癥重，有時可能導致嚴重并發癥。細菌性結膜炎經過及時治療后可以較快將細菌消滅，對眼部造成的損傷較小。此外，病毒性結膜炎較為少見、病情較兇險但治愈較快。病毒性結膜炎治愈較慢，并且遺留并發癥、后遺癥較多。