根管治療過程中，如存在根管鈣化，或由于既往進行過根管治療，尤其進行過塑化治療時，可能會出現根管不通。隨著根管治療技術的發展，可在超聲、顯微鏡，或其他輔助器械下，將根管進行疏通。如果根管無法完全疏通，在根尖并沒有明顯的炎癥的情況下，可將部分根管疏通，完善根管治療，然后將牙齒進行填補，如果沒有其他癥狀，患者可繼續使用。如果在牙齒使用過程中出現問題，可做對應處理，如將其拔除，如果通過根管治療無法治愈，根尖炎癥又無法控制，此時可能需要將其拔除或進行截根，將能夠疏通的牙根保留，之后進行打樁、鑲牙。部分患者雖然根管沒有疏通，但沒有癥狀，牙齒可繼續使用。如果能夠進行疏通，且治療效果較好，使患者更加放心，但部分牙根確實難以疏通。