精子畸形率90%時一般不能生育，正常精子畸形率保持在30%以下時大多能生育。當精子畸形率超過70%以上，大多是染色體異常引起，要做染色體篩查。精子畸形率90%時不建議自然受孕，也不易自然受孕，即便懷孕，也可能出現胎兒早產、流產、發育畸形，成人后可出現畸形改變。此時建議做染色體篩查，排除遺傳性疾病后再挑選優質精子進行人工授精或做試管嬰兒，大多選擇二代試管嬰兒，效果更好。精子畸形大多由染色體改變引起，發生時要查明病因，和較多因素有關，如應用藥物，包括化療藥物，或經放射性治療。此外，前列腺炎、精索靜脈曲張、腮腺炎引起的睪丸炎、睪丸結核，以及患過癌癥等，均可引起精子畸形發生。