系統性紅斑狼瘡強調個體化治療，因為系統性紅斑狼瘡的情況因人而異，不同患者病情程度、受累的系統和臟器不盡相同，因此需要制定個體化治療方案。原則上系統性紅斑狼瘡，應該根據病情的輕重應用激素加免疫抑制劑治療，輕癥患者可以應用中等量或小量激素加免疫抑制劑，重度活動患者可能應用足量激素加免疫抑制劑，危重患者可能應用激素沖擊治療，或結合免疫抑制劑大劑量沖擊治療。 系統性紅斑狼瘡還可應用中西醫結合的辦法，通過扶正祛邪、補益肝腎、補益脾胃，調節臟腑功能，祛風散寒、活血通絡、驅散邪氣，達到協同治療，減少西藥副作用的目的。