肥厚型心肌病并不能根治，大部分肥厚型心肌病屬于遺傳性疾病，是心臟肌球蛋白基因發生突變引發，而且肥厚型心肌病大多呈現家族遺傳特性，比如父親有肥厚型心肌病，可能下一代當中檢出肥厚型心肌病的概率明顯增加。臨床上一旦發現肥厚型心肌病，會讓患者做家系基因異常檢測，對他的上一代和下一代進行基因檢測，即使沒有家系遺傳，單純肥厚型心肌病臨床治療也不能得到根治。所有治療肥厚型心肌病的方式，都是改善病人生活質量、延長生命。現階段治療包括藥物治療、非藥物治療、介入治療或者外科手術切除肥厚部分，但不能達到根治效果。