肥厚型心肌病自出生以后就有心臟猝死的風險，因此不建議肥厚型心肌病的患者進行劇烈運動，特別是有競技性的體育活動，比如賽跑、打籃球等，但是不能讓患者遠離活動，可以正常活動，只要不進行劇烈運動。特別在國外針對運動員猝死的研究發現，部分猝死運動員尸檢顯示是肥厚型心肌患者。國外運動員如果篩查出已經出現肥厚，要終止競技性運動。 肥厚型心肌病分不同類型，如果心尖肥厚可能影響較小，如果室間隔肥厚，劇烈運動時造成流出道狹窄，壓力加大會觸發患者暈厥和猝死。肥厚型心肌病的患者可以運動，但不要做劇烈運動，正常有氧運動是散步、慢跑或快走。只要患者沒有癥狀，或不是猝死高危家族史的患者，或本身猝死風險不高時，適當活動對患者身心可能都有好處。