肥厚型心肌病通常會出現遺傳，因為肥厚型心肌病本身屬于一種遺傳病。目前認為肥厚型心肌病是一種常染色體顯性遺傳病，遺傳模式符合孟德爾遺傳規律，在直系親屬當中有50%人群會發生同樣的疾病。目前已經證實，肥厚型心肌病是一個單基因遺傳病，發生突變與至少20個基因突變相關。若對某個肥厚型心肌病進行較全面的基因診斷，則至少會發現基因突變和本病有關。所以對于肥厚型心肌病患者，一般建議做基因診斷或者遺傳咨詢，因為基因診斷能夠提供較完整的家系圖譜，為患者之后的生育選擇提供一個較科學的解釋。 另外，肥厚型心肌病往往表現為家族聚集現象，是指臨床發生肥厚型心肌病的患者，在上一輩或下一輩都能找出該病例，換句話說，發現有肥厚型心肌病的患者有一定直系血緣關系。