因為乳腺鱗狀細胞癌發病率比較低，所以沒有國際上的指南建議及共識。通常采用局部治療及全身治療并重的治療方式，醫生會根據腫瘤的分期和患者的身體狀況，酌情采用手術、放療、化療、內分泌治療、生物靶向治療以及中醫藥輔助治療方法等多種手段。 外科手術是根治的主要方法。放療是利用放射線破壞癌細胞的生長、繁殖，達到控制和消滅癌細胞的作用。相比較其他部位鱗癌放療敏感的特點，乳腺癌對放療不敏感。對于鱗癌患者，如果做保乳手術應該慎重，手術、放療均屬于局部治療，化療是一種應用抗癌藥物控制癌細胞分裂，破壞癌細胞的治療方法，簡稱化療。乳腺癌對化療不敏感，多推薦含鉑化療方案。 內分泌治療是采用藥物或去勢內分泌藥物的方法調節機體的內分泌功能，減少內分泌激素的分泌，從而達到治療乳腺癌的目的。依據受體情況的不同，代表藥物有氟維司群、來曲唑、阿那曲唑、依西美坦、他莫昔芬等。分子靶向治療是近年來最為活躍的研究領域之一，與化療藥物相比有許多緩解作用機制的新型抗腫瘤治療藥物，HER-2陽性的乳腺癌患者應用赫賽汀和帕妥珠單抗1年，可以減少疾病的復發率。