抗抑郁藥的副作用有兩部分，第一是與5-羥色胺相關，這部分主要是指5-羥色胺能受體被影響之后所出現的一些問題，比如常見的消化道的癥狀，如食欲下降、惡心、反酸、腹脹等。可能會有失眠的問題，比如失眠不連貫，失眠可能會有情緒、情感的遲鈍，然后記憶力的下降，可能會有心率的減慢、頭痛，還可能會影響性功能。當5-羥色胺的這種影響到了極致，就可能會出現5-羥色胺綜合征，5-羥色胺綜合征是一個比較嚴重的抗抑郁藥不良反應，表現為三個興奮，第一個是精神興奮，第二是肌肉興奮，第三是自主神經興奮。病人會高熱、大汗，然后頭暈、肌張力亢進，肌肉的活動會過分興奮甚至僵直，人很激越、激動。除了5-羥色胺相關的以外，可能與去甲腎上腺素有關系。表現為煩躁、焦慮加重，可能會有激越、容易發火、容易生氣，還可能會有體重的減輕等，這個與去甲腎上腺素能有關系。5-羥色胺和去甲腎上腺素能合在一起，就是抗抑郁藥的主要不良反應。