尿液里面支原體、衣原體、淋球菌是比較常見的微生物，泌尿系衣原體感染具體治療方法如下：1、藥物治療：如果是衣原體感染，相對比較麻煩，特別是對于女性患者，可能帶來比較麻煩的盆腔炎，此時需要通過口服藥物來治療，像左氧氟沙星等喹諾酮類藥物，或者阿奇霉素等，進行抗真菌、抗微生物治療，也可以進行藥物敏感試驗；2、一般治療：在藥物治療的同時，注意個人衛生也非常重要，性生活前后個人的衛生，需要注意經常清洗會陰、勤換內褲。同時在飲食上可以保持清淡，避免食用重口味的食物，如辛辣食物或者酒精類的藥物、酒精類的食物等可以降低盆腔炎的發生。女性如果有支原體、衣原體感染，其性伴侶也要重視，特別男性同志如果有包皮過長、包莖、包皮外翻困難或者附睪炎、前列腺炎，也需要夫妻共治，也要通過藥物進行治療，檢查尿常規和前列腺液，部分患者如果有分泌物可能還要涂片。總的來說，有微生物存在，有衣原體存在，需要互相配合，藥物控制。