肩胛骨疼痛病因較多，常見原因如下：1、外傷：常見的外傷可以造成骨折、脫位，有比較強烈的暴力造成的損傷，如車禍傷、高處墜落傷，或者暴力擊打局部造成骨折。尤其粉碎性骨折比較嚴重，可能出現肩關節脫位，疼痛較為劇烈；2、炎癥：肩胛周圍肌肉和筋膜造成慢性勞損，因為肩關節是人體活動的重要關節，在日常生活中上肢活動離不開肩胛骨的支撐，如果活動不當或活動過重，容易造成肩胛骨周圍肌肉、筋膜勞損，出現疼痛，嚴重時出現活動受限；3、腫瘤病變：由于肩胛骨血運比較豐富，容易發生腫瘤，如惡性腫瘤，包括尤文肉瘤、軟骨瘤等，腫瘤破壞骨質或者壓迫周圍組織，也會引起比較明顯的疼痛；4、免疫系統疾病：如風濕疾病、類風濕疾病等，可以引起肌肉關節損害；5、內臟系統疾病：如心臟病有時向胸背部放射，肩胛區會出現疼痛，如胸膜炎、肺部病變、肝膽系統病變，會出現肩胛區放射性疼痛，有時被誤認為是肩胛骨疼痛。