肩胛骨內疼痛的常見原因是肩胛骨腫瘤、肩胛骨骨折等疾病，具體情況如下：1、肩胛骨腫瘤：肩胛骨可以發生原發性的良性骨腫瘤或者轉移性的惡性骨腫瘤，均可以導致局部占位，與周圍組織發生壓迫或者造成骨質破壞，從而引起肩胛骨內疼痛。通過CT掃描通常可以確診，一般需要采取手術的方法對腫瘤部位進行切除，并結合病理組織學檢查明確腫瘤的嚴重程度；2、肩胛骨骨折：肩胛骨骨質比較菲薄，受到外力作用，很容易發生肩胛骨骨折。肩胛骨骨折會有移位，產生骨膜神經損傷，會引起肩胛骨內部的疼痛，并伴有腫脹、局部塌陷畸形、肩關節活動受限。拍攝CT能夠進一步確診，一般需要進行固定治療，嚴重的患者需要采取切開復位內固定手術治療。綜上所述，為明確肩胛骨內疼痛的具體原因，可以咨詢骨科門診醫生。專科醫生會通過問診、體格檢查、影像學檢查結果綜合判斷，確定病因，盡快為患者制定詳細的治療方案，使疼痛癥狀徹底消除。