碎石后還是疼主要有以下原因：1、碎石后損傷：沖擊波碎石、各種碎石的方法，造成局部黏膜損傷，腎結石、輸尿管結石損傷后，局部會有酸痛等感覺；2、結石未排完：碎石后結石未排完，引起輸尿管的梗阻、引起腎臟的積水，局部還會疼痛，有時疼痛還比較重；3、尿路感染：碎石后造成尿路的感染，尿路感染后，細菌和部分炎癥物質引起黏膜的水腫，刺激尿路的上皮，引起相應的部位的疼痛，包括腎區的疼痛、膀胱區的疼痛等；4、管路刺激：碎石后放的管路，如雙J管碎石后，放雙J管來支撐住輸尿管、引流腎臟，管的刺激也會引起術后疼痛。根據疼痛情況，查尿、拍片，查B超，看是否有腎積水、尿紅細胞多少、白細胞多少，是損傷、炎癥、積水，采用解痙消炎、對癥治療，就可以解決疼痛問題。