牙齦囊腫手術通常不痛苦，因牙齦囊腫面積一般較小，而對于面積較大的牙齦囊腫，在手術的過程中也不會較痛苦，只是可能會出現輕微疼痛、腫脹、不適等，主要內容如下：1、術前進行詳細檢查、評估以及和患者進行詳細溝通，進行心理疏導，因大多數患者手術前精神會緊張、壓力增大，此時要用專業知識及手術成功案例進行詳細講解，減輕對手術的顧慮。同時將手術的過程進行告知，消除心理恐懼且做好相應檢查，將囊腫的大小、范圍、位置進行分析和定位；2、術中進行麻醉并展開相應的手術，整個手術過程則不會感覺痛苦；3、術后進行優質的護理并且及時給予止痛和抗炎治療，手術則能達到較好的治療效果。