對于牙齦囊腫，要根據囊腫的部位、面積和大小而決定相應不同的治療方案。針對面積較小的牙齦囊腫，密切觀察并且找到導致原因。1、牙齦炎、牙周炎或食物嵌塞：只要將牙菌斑、牙結石及牙齒周圍的炎癥去除，牙齦囊腫就可以得以改善。如通過全口潔治、齦上潔治和齦下刮治，并且給予漱口液漱口。另外可以給予相應的藥物涂抹。如果以上方法都不能解決牙齦囊腫，可能要考慮采取手術的方法解決。建議患者盡早到正規醫院的口腔科或口腔醫院口腔頜面外科，找醫生進行仔細的檢查、評估、拍片、分析等，將囊腫進行切除后再進行病理分析檢查，決定進一步的治療方案；2、牙髓炎或根尖周炎：多半考慮進行患牙根管治療術，從根本上解決牙齦囊腫的問題。