射頻消融與左心耳封堵術均是用于治療房顫的手段，不同之處在于射頻消融主要目的為根治房顫，而左心耳封堵主要將器件放于左心房，因左心房內左心耳為血栓源頭，左心耳封堵主要將源頭堵塞，兩者治療方式稍有區別。兩者相同之處為預防卒中，因房顫為引起卒中主要原因，導管消融主要去除房顫。而房顫發作患者血栓多來源于左心耳，將源頭堵住后血栓風險也會大幅度降低。另外，射頻消融與左心耳封堵術需經過相同路徑到達左心房，部分醫院及醫生可能會選擇在同次、同天進行，術中需用到相同耗材，稱為一站式手術，可減少患者痛苦及花費。