幽門螺桿菌的檢測分為有創和無創。有創檢測，如快速尿素酶，它放置在特殊的試劑中會有不同程度的顯色，顏色越深說明幽門螺桿菌程度感染越重。病理檢測，取活組織在顯微鏡下能夠看到明顯的幽門螺桿菌的形狀，確認幽門螺桿菌的感染。無創常用碳13和碳14呼氣試驗，試劑的不同有不同的標準，而且碳13和碳14的正常檢測值也不同。碳13一般情況下以4為界，碳13一般小于4是陰性，臨床上根據大于4的程度來判斷是否合并幽門螺桿菌的感染，而碳14不同的單位標準值也不同，有的是50以下為陰性，有的是100以下為陰性，要看具體情況而定。