腸鏡檢查結束后，很多病人提出不舒服、不適應，甚至于腸鏡檢查結束后，病人明顯地表現出來有腹痛的跡象，這個過程主要的原因在于做結腸鏡檢查過程中要向腸腔內大量充氣體擴充腸腔，擴展后才能進行良好的觀察。腸鏡檢查結束后，良好的排氣和用溫熱食物進行正常飲食，大多數患者都能恢復。偶爾有一部分病人相對比較敏感，對結腸鏡檢查過程當中的牽拉性作用，反應比較強烈比較敏感的時候，表現為持續1-2天腹部隱隱作痛的表現，良好的觀察即可，不需要刻意用藥。尤其是95%以上的病人，隨著時間的推移，1-2天以后，患者的感覺都會消失掉，必要的時候可以來到醫院就診，甚至向主管醫生嚴格表明癥狀，相應配合用藥物，來解除后期的不適應癥狀。