腸鏡簡單來講就是從肛門進鏡，經過相關操作使腸鏡頭端達到大腸和小腸交匯部，俗稱回盲瓣，進入到末端回腸。從末端回腸開始逐步緩慢推進，推進過程中觀察腸道黏膜相關變化，包括黏膜色澤、黏膜下血管走行及黏膜表面紅斑、隆起、新生物等。 腸道檢查要求退慢，逐步往后退，腸道當中有很多結腸袋，結腸袋背后都不易觀察，所以在檢查過程中通常會往返，重復簡單過程，目的是為提高腸鏡下病變檢出率。