小腦萎縮在臨床上也比較常見，更常見的是一種變性病或退行性病變，在臨床上比較常見的是脊髓小腦性共濟失調，這些可能跟遺傳有關系。還有多系統萎縮，像感染、橋腦、小腦萎縮或MSA-C型即小腦型多系統萎縮，對于這類疾病，目前沒有特別好的方法，無論是藥物還有其他治療都沒有特別有效的方法。但是對于小腦萎縮，可以給患者營養腦細胞的治療，可以使用胞二磷膽堿、艾地苯醌、輔酶Q10、恩必普即丁苯酞等治療，可能會有部分效果。但總而言之小腦萎縮目前沒有特別好的治療方法，主要可以使用非特異性藥物延緩病情進展。