腦血栓形成最重要的危險因素是動脈粥樣硬化，動脈粥樣硬化是一個長期慢性的發展過程。體內巨噬細胞吞噬脂質形成泡沫細胞，然后在內皮下面堆積，逐漸導致動脈粥樣硬化斑塊形成。當動脈狀硬化斑塊表面的纖維帽較薄，脂質核較大，或者是表面有潰瘍等不穩定的斑塊情況下，在這個地方容易形成血栓，導致血小板聚集，還有纖維蛋白原把血小板粘連在一起，形成小栓子，把血管堵住，形成血栓。在動脈粥樣硬化的防治方面，常見使用他汀類藥物，可以降低血脂，對不穩定斑塊進行穩定，使斑塊纖維帽會較厚，脂質核較小，防止腦血栓形成。