腦梗引起的小腦萎縮如需服藥，主要應服用腦梗藥物，因為小腦萎縮主要通過康復鍛煉進行功能康復，并沒有針對性藥物可以改善。此外需明確腦梗病因，根據病因給予針對性藥物治療，常見如下：1、動脈粥樣硬化性因素：需要使用阿司匹林、氯吡格雷以及他汀類降脂藥物，如阿托伐他汀、瑞舒伐他汀等治療；2、栓塞導致：如心源性栓塞，可使用抗凝藥物預防血栓發生，如華法林、利伐沙班、達比加群等；3、血管炎引起：抗血小板同時需使用免疫抑制藥物，根據不同病因進行選擇，常用類固醇激素治療；4、其它病因：如可逆性腦血管收縮綜合征，誘因去除之后無任何癥狀，則無需長期口服藥物治療。