肝內膽管結石具體怎么處理，主要是取決于肝內膽管結石是否有引起一些相關的并發癥，同時也要取決于肝內膽管結石的數量、大小。具體處理分析如下：1、觀察：如果肝內膽管結石的數量比較少，也沒有引起相應的癥狀和肝臟的一些器質性改變，可以先觀察。但是一定要密切地隨訪，定期地復查，以觀察是否有出現其他異常改變；2、消炎對癥治療：如果肝內膽管結石數量比較多，容易引起膽道感染的改變，反復地出現右上腹痛、發熱、感染的表現。這種情況就需要進一步處理，包含保守控制、消炎、對癥處理；3、手術治療：如果癥狀反復發作，比如反復發作的肝內感染，會引起肝膿腫的風險，也會引起膽管壁增厚，包括肝臟萎縮，甚至引起膽汁性肝硬化。針對這一類的情況，需要及早地進行手術治療，手術目的就是要取盡結石、去除病灶、通暢引流、防止復發。最好的辦法就是將結石取干凈，能杜絕進一步的肝臟異常病變。因為長期的結石反復感染，有可能會小概率發生肝內膽管癌。如果有反復發作的肝內膽管結石，一定要及早處理。