心肌炎的后遺癥這也是廣大患心肌炎的患者們特別關注的問題。一般而言，彌漫性的心肌炎會導致心臟功能發生變化，患者在臨床上會有活動以后氣短情況。如果導致全心衰，患者會出現下肢水腫，飲食納差，全身乏力的情況。另外，心肌炎癥影響到心臟的電活動，電傳導系統，會發生心律失常，比如房室傳導阻滯或者是有頻發的室早、室速。如果是患者出現心功能異常，需要長期定時到門診隨訪，需要給予長期改善心臟功能的藥物，比如口服利尿劑降低心臟的前后負荷，改善患者的氣短情況。還需要給予血管緊張素轉換酶抑制劑或者是β受體阻滯劑長期改善患者心臟重構，預防患者心臟進一步擴大，控制患者心肌炎以后伴發的心功能不全。