頭部核磁共振主要可以檢查以下幾種疾病：1、腦血管病：腦梗死、腦出血的患者通過頭顱核磁共振，可以判斷是急性期、恢復期、液化期還是后遺癥期，還可以觀察到發生病變的部位；2、顱內炎癥：例如病毒性腦炎患者的頭部核磁共振里可以看到腦水腫，特別是細胞毒性水腫的病變。炎性脫髓鞘常見多發性硬化，可以看到發生脫髓鞘的病變部位，甚至可以通過頭部核磁共振的增強進一步明確病變性質，如脫髓鞘病變、血管炎病變或其它疾病；3、腫瘤性疾病：幫助明確是否是腫瘤，如顱內的轉移瘤、膠質瘤等；4、代謝性腦病：比如韋尼克腦病。頭部核磁共振可以非常清晰地觀察顱內疾病，還可以通過頭顱磁共振的MRA(核磁共振血管成像)檢查，從而明確是否存在動脈和靜脈系統的病變。