食道黏膜損傷主要由于反流造成，患者可出現反酸、燒心或上腹部及胸骨后疼痛。此外，進食過燙、過硬或粗糙食物后，患者也可出現上述不適癥狀。 部分患者神經敏感性較差，出現較重炎癥時癥狀不明顯；部分患者食管處于高敏感狀態，出現輕微反流時即可出現癥狀；部分患者的食管癥狀與損傷無關，稱為功能性胃腸病或功能性燒心、功能性胸痛，此類患者未受到任何外界強刺激以及并無肉眼可見的損傷，即可出現相關癥狀。