安必仙和阿莫西林的區別，在于是不同種類的抗菌藥物。這兩種藥均屬于青霉素類抗菌藥物，從大類上均屬于β-內酰胺類抗菌藥物，結構中均有β-內酰胺環。但青霉素類藥物是一大類，里面有較多不同青霉素，除普通青霉素，還有阿莫西林、美洛西林，磺芐西林、氨芐西林等。安必仙亦稱氨芐西林，阿莫西林同屬于青霉素，卻是不同種類。不同企業會單獨給附屬廠家生產的藥品取一個商品名，以此區別其他企業的命名，而通用名是藥典規定的唯一法定名稱。這兩個藥的名字差別較大是因為安必仙藥物的命名屬于商品名命名方法，而阿莫西林屬于通用名命名方法。比較兩種西藥時，最重要的是對比通用名，不應僅對比商品名，以免造成誤判。