指甲蓋脫落有多種原因，基本病變都是指甲甲根部甲母質受到嚴重損傷導致其功能障礙，甲板生長停止，指甲蓋出現脫落。指甲蓋本身如果受到外傷也可以導致甲蓋脫落，具體誘因除外傷外，比較常見的就是指甲部位感染，特別真菌感染引起的灰指甲又稱為甲癬。真菌感染后可以導致指甲明顯破壞、畸形，并可以導致指甲蓋脫落。另外細菌性甲溝炎可以影響到甲根部甲母質細胞功能，也可以導致指甲蓋脫落。再就是全身性因素，比較常見的有感染高熱疾病，就會影響到甲根部甲母質功能，使其暫時性停滯，指甲停止生長后出現脫落。還有比較嚴重的皮膚疾病，比如紅皮病又稱為剝脫性皮炎，或者大皰、表皮壞死松解型藥疹都可以引起甲母質明顯功能障礙，出現指甲脫落。還有可能藥物影響，比如免疫制劑、化療藥物等也可以導致甲母質功能異常，出現指甲脫落。