扁桃體手術符合手術適應癥時，術后無明顯后遺癥及危害。術后可能短期內會有出血，但通常可以控制，還可能有發燒、咽痛等癥狀，通常1周內會逐漸緩解及痊愈。扁桃體手術適應癥包括急性扁桃體炎反復發作，病程1年反復發作7次或以上，病程2年，每年反復發作5次或以上，病程3年，每年反復發作3次或以上，達到此發作頻率，則需考慮手術切除扁桃體。如果扁桃體有良性腫物或扁桃體肥大導致阻塞性睡眠呼吸暫停、吞咽阻擋感、說話不清晰且有含物音，均符合手術適應癥，可以考慮手術切除扁桃體。