扁桃體長期發炎不會引起癌變，通常是慢性扁桃體炎，在扁桃體急性發炎期間病人會有高燒、咽痛及吞咽疼痛明顯。檢查時可以發現扁桃體充血、腫大、有膿性分泌物，經過抗炎治療后即可消退。少數扁桃體炎急性發作未控制良好或未及時治療，反復遷延成慢性扁桃體炎，可以導致病人長期有咽喉異物感、燒灼感及反復出現感染。部分病人會出現遠期并發癥，如腎炎、風濕性關節炎、風濕性心臟病等，此時需要考慮扁桃體切除手術。同時存在病人扁桃體由于反復發炎導致肥大較明顯，引起咽腔狹窄、打鼾，存在睡眠呼吸暫停綜合征，也需要將長期發炎的扁桃體進行切除。