治療灰指甲的藥物對身體是有害的，是藥三分毒，不管是外用藥物還是口服藥物，對身體都有一些不良的影響。1、外用藥物相對來說它的副作用小一些，它的副作用大部分就是局部的副作用，對于灰指甲的外用藥物，它除了對指甲有抗真菌作用之外，對周圍的皮膚可能有刺激的反應，所以要規范地去使用，并且注意一些注意事項。2、對有一些口服的抗真菌的藥物，它相對來說副作用大一些，藥物多多少少都有一些副作用，特別是抗真菌的藥物，對肝功都多少有一點影響。所以肝功不正常的一定要注意禁用，或者是要在醫生的指導下去使用，并且在治療以后要定期檢查肝功，以防止藥物的一些副作用發生。