難治性腎病綜合征臨床通常會采取聯合細胞毒藥物或免疫制劑治療，難治性腎病綜合征主要分為激素依賴型和激素抵抗型。激素依賴型指激素在測檢過程中減到一定程度后，患者腎病綜合征會復發。激素抵抗性，即激素使用到8-12周后仍沒有任何效果，臨床常用免疫制劑包括他克莫司、環孢素及環磷酰胺等藥物。近幾年較新出的藥物里，利妥昔單抗也可用于腎病綜合征治療。 對于腎病綜合征病人，一定要進行腎穿刺活檢，且腎穿刺活檢后必須進行光鏡、電鏡、免疫熒光檢查，尤其為電鏡檢查。如果不進行電鏡檢查，單純應用激素或免疫制劑，通常無法起到良好治療效果，因發病機理不同，一定要完善腎穿刺活檢檢查。