囊腫根據其部位和大小不一樣，癥狀也略有不同。對于比較小的囊腫，如體檢時通過做超聲發現的甲狀腺小囊腫，可以是幾個毫米，甚至1cm，或者肝臟內部的小囊腫，絕大多數沒有癥狀。而隨著囊腫增大，會引起局部壓迫癥狀，如肝臟比較大的囊腫，臨床上可以見到有8cm或者10cm，同時局部張力較高。當囊腫張力比較高，可以造成局部疼痛不適的感覺。如婦科卵巢囊腫較大時，也會出現下腹部的脹疼。當囊腫扭轉時，還會出現急腹癥。當囊腫破裂時會導致出血，甚至急性腹疼。因此，囊腫的癥狀根據其大小、位置，以及是否發生破裂和扭轉都有關系。建議患者一旦出現囊腫，在比較小時不急于進行任何干預，可以臨床觀察。而一旦比較大，隨時有破裂風險，就應該積極采用手術方法進行切除。