早上起來嘴巴發苦，并且有臭味，其原因很多，首先由于患者的口腔衛生情況較差就有可能會導致問題的發生。對于患者如果有齲病、牙髓炎、根尖周炎，以及牙周炎、牙齦炎的患者，由于口內有相應的食物嵌塞，或者有牙結石、菌斑等這些致病因素的堆積，都是導致嘴巴口臭，以及口苦的始動因子。出現上述情況，建議盡早進行根管治療，進行去齲、沖洗、消毒、隔濕、吹干，進行充填修復，進行冠周沖洗上藥，進行全口節制等，將口腔衛生徹底改善和清除干凈的方案，從而可以改善早上起來嘴巴苦、臭的問題。另外還有可能是由于患者胃腸道消化不良、消化系統紊亂從而引起嘴巴苦、臭。另外，跟患者的咽炎以及鼻炎等也可能有一定相關性。患者如果有內分泌功能紊亂，或全身系統性疾病也可能會引起早上起來嘴巴苦、臭，要根據病因給予相應正確的治療。