經皮腎鏡是在腰部建立一條從皮膚至腎臟的通道，通過該通道將腎鏡植入腎臟，利用激光、超聲等碎石工具將腎結石擊碎、取出的手術。經皮腎鏡手術屬于微創手術，但需要在腎臟取一個洞。如果有需要，可能需要輸血，甚至需要進行介入栓塞止血治療。部分腎結石比較復雜，需要進行多次經皮腎鏡手術才可將結石取得比較干凈。由于醫院、手術難度以及術后恢復不同，經皮腎鏡碎石手術的費用也不同，目前開展經皮腎鏡碎石手術的費用大約為一萬元。