小兒便秘主要指排便次數減少、糞便量減少、糞便干結、排便費力困難等。如果超過6個月，即為慢性便秘。便秘從病因上可分為器質性和功能性兩類。兒童便秘主要是功能性便秘，食物進入消化道經消化道消化吸收之后的殘留物、腸道細菌及膽道排泄物形成大便，食物的種類、量、小兒腸道的吸收能力、腸道運動速度均影響大便的顏色、性質和量。正常嬰幼兒從食物進入消化道至糞便排出的時間，母乳喂養的嬰兒平均13個小時，人工喂養平均為15小時，成人平均18-24小時。 嬰幼兒便秘多數為功能性便秘或故意不解大便，占90%-95%。大半起因與父母急于訓練嬰兒大小便習慣所造成，同樣問題可重復出現。一開始可能是由于反抗大小便訓練，后來由于大便變硬、解便會痛，于是變成怕痛不解，越不解越積越多，形成惡性循環。后遺癥造成腹痛、肛裂、肛門流血，腹壓太高壓迫到尿道，引起泌尿系感染或大便失禁。