急性牙周膿腫治療原則應以止痛、防止感染擴散及排膿引流為主。初期膿液尚未完全形成之前，可清洗牙周袋，局部沖洗上藥，適當時可配合全身抗生素使用或支持療法。 但在膿液形成且局限，出現波動感時，要根據膿腫部位及表面黏膜厚度，選擇從牙齦或者牙周袋表面進行及時排膿引流，切開后應該徹底沖洗膿腔或在局麻下徹底進行齦下清創術。同時配合局部藥物和全身抗生素，也可輔助使用激光、口服止痛藥等，縮短愈合周期、減輕患者疼痛。 在急性膿腫消炎處理之后，還要進行進一步序列治療，控制牙周炎、減輕膿腫發生幾率。