自體造血干細胞移植這項技術非常成熟，從上個世紀70年代已經開始開展。自體造血干細胞移植風險相對比較低，因為是用自己的造血干細胞支持大劑量化療。移植相關的并發癥多見比如感染、出血并等發癥，還有其它出現機會比較低的并發癥，比如干細胞采集數量或者質量有問題。 還有造血重建有問題，造血無法重建如同再障樣的表現，也是自體造血干細胞移植的風險。還有其它非常罕見的嚴重并發癥，但總體安全性比較高，嚴重不良反應的發生率比較低。