干細胞移植有副作用。骨髓移植過程中，患者容易出現感染、出血、心衰、腎衰，肝功能異常的風險。移植后，患者容易出現移植物抗宿主病，具體如下：1、急性移植物抗宿主病：主要表現為腹痛、腹瀉、皮疹、肝功能的異常以及膽紅素的升高；2、慢性移植物抗宿主病：主要表現為肌肉、關節、皮膚以及黏膜的變化，類似于風濕性疾病、結締組織病這些免疫性的反應，嚴重的患者會出現肺部的細小支氣管炎，導致患者的生活質量嚴重下降合并感染，因為長期需要用免疫制劑，一旦合并感染，病人死亡率也相當高。