神經源性角膜炎最主要的就是對因治療，神經源性角膜炎主要是由于支配角膜的三叉神經損傷引起，如單純皰疹病毒或帶狀皰疹病毒感染后可出現。此外，有些三叉神經切斷術后或做準分子激光手術后，神經也會有損傷，還有休克、糖尿病患者都會出現神經損傷。有些腫瘤患者放療術后，聽神經瘤術后都會導致三叉神經損傷，從而導致神經源性角膜病變，所以對因治療非常重要。 除對因治療，還要給予營養藥物，像潤滑眼表和促進角膜上皮修復的藥物。患者還可配戴角膜接觸鏡，促進角膜愈合，進行局部包蓋。嚴重者可能需要手術，進行羊膜移植、結膜瓣遮蓋手術，或是瞼裂縫合手術。