傳統認為朗格漢斯組織細胞增生癥是一種良性疾病，但在不同患者身上，臨床差異較大，嚴重程度取決于患者的發病年齡、病變部位和范圍、受累的器官功能異常程度。通常發病年齡越小，受累器官越多，病情則越嚴重；發病年齡越大，病變越局限，癥狀越輕微，患者的預后相對較好。 因此病情輕的患者僅表現為孤立性、無痛性的骨骼病變，甚至會自發緩解。嚴重者可以發生廣泛的累及全身多器官多系統的損害，如累及骨髓、肝脾。患者可出現發熱、貧血、黃疸、消瘦等臨床表現，通常治療效果較差，預后不良。