朗格漢斯細胞組織細胞增生癥轉移至腦顱可以治愈，要分清楚轉移具體部位及是否引起中樞神經系統功能改變。如影響垂體，可能出現多飲、多尿，可以治愈。部分病人轉移至腦實質，相當于占位病變，此時需神經科醫生共同確定轉移灶性質及是否需要進行外科干預，也可通過化療藥物穿透血-腦屏障，給予治療。 除此以外還應分析有無基因突變，存在基因突變者細胞惡性程度較高，可穿透血-腦屏障，種植于腦實質部位引起相關癥狀，如癱瘓、抽風、驚厥及腦功能異常。此時需神經科、外科及腦神經科聯合制定治療方案。化療藥物較少能直接透過血-腦屏障進入受累部位，但靶向藥物為小分子制劑，可通過血-腦屏障進入并作用于受累部位，以達治療目的。