龜頭顏色發黑原因如下：1、正常生理現象：最常見于青春期后男性，由于青春期發育成熟后男性睪酮水平逐漸升高，容易導致生殖器官出現色素沉著、顏色發黑。青春期前后男性會出現龜頭和包皮明顯發育，包皮生長速度明顯低于陰莖龜頭生長速度，導致包皮后移、龜頭外露，約70%的男性會出現龜頭和陰莖明顯發育，還會出現喉結變大、聲音低沉、骨骼肌和身高明顯變高；2、病理現象：反復發生龜頭包皮炎的男性，包皮龜頭霉菌反復感染時會導致龜頭表面皮膚出現片狀發灰和褐色，局部會伴有瘙癢或皮疹，部分男性還會出現包皮垢。龜頭局部發黑，需及時到泌尿外科或男科就醫。