Y染色體缺失不能治愈，Y染色體缺失會影響男性的生育功能，表現為無精子癥，少數患者可能會出現重度少精子癥，即精液中存在少量精子，但難以自然生育。對于Y染色體缺失的男性，主要的治療目標是找到精子，幫助患者實現生育目的，此時可以通過試管嬰兒的方式幫助患者獲得后代。若男性的精液中無精子，稱為無精子癥，需根據缺失區域考慮治療方法。若a區及b區缺失，則找到精子的概率通常較低，建議直接通過精子庫供精。若c區缺失，可以通過睪丸活檢或睪丸顯微取精的方式找到精子并進行試管嬰兒。Y染色體缺失是先天性疾病，不具有遺傳性，只在懷孕過程中可能出現Y染色體突變導致缺失，其他功能通常不會受到影響，但通過服藥、手術均無法治愈。