化膿性中耳炎的治療分為急性期和慢性期。在急性期，也即初次發作化膿性中耳炎的時候，治療以抗炎為主，口服或靜脈注射抗生素，一般首選青霉素類或頭孢類的抗生素，然后外用耳道內的滴耳液治療。當然在進行外用的滴耳液之前，首先要清理掉外耳道里邊的膿性的分泌物，保持外耳道的清潔狀態下再進行滴藥才可以發揮相應的作用。 急性期的中耳炎治療以后如果反復發作轉為慢性化膿性中耳炎，慢性化膿性中耳炎在急性發作的時候也是進行相關的治療。但是如果持續的流膿，這種情況下就要首先進行中耳乳突CT的檢查，檢查否存在中耳及乳突內有肉芽病變或是否合并了息肉或膽脂瘤。如果是有肉芽、膽脂瘤或息肉等形成的話，就要考慮相關的手術治療。如果說沒有這種情況，只是單純的流膿癥狀，治療方法還是口服抗生素或加滴耳液，同時可以進行相關的外耳道的局部照射治療進行相關的理療。如果說在化膿性中耳炎的靜止期即沒有在流膿感染的情況下，就要避免耳道內的進水，然后同時要進行全身狀況的調理。如果存在鼓膜穿孔的情況下，在化膿性中耳炎的靜止期可以考慮做手術進行鼓膜穿孔的修補。