巧克力囊腫的復發時間不是一定的數字。巧克力囊腫又名子宮內膜異位囊腫，在手術過程中會發現其內包裹陳舊血液，類似巧克力，所以稱為巧克力囊腫。巧克力囊腫需進行剝除手術，此為保留卵巢的手術，術后復發概率大概有40%，通常復發時間在術后2年左右。 雖然巧克力囊腫多數為良性，但其有著惡性行為表現，會侵蝕周邊的臟器，與周邊臟器形成粘連。手術過程中可能存在肉眼看不到的巧克力囊腫，而無法看到，也無法剝除，會存在復發，內增細胞也是易復發的原因。所以巧克力囊腫術后需長時間的綜合管理，除手術中盡量剝除巧克力囊腫病灶外，術后需用藥進行綜合的長期管理。