阿莫西林是抗生素，常見的口腔潰瘍沒有感染，而且復發性口腔潰瘍跟感染無關，所以不選用阿莫西林治療口腔潰瘍。最常見的復發性口腔潰瘍，病因不是很清楚，認為與遺傳有關，但是同時也與生活不規律、熬夜、大便干燥、不小心咬傷有關。所以通常以局部治療為主，消炎止痛、促進潰瘍愈合。局部選用的藥物多數是糖皮質激素、生長因子、局部使用中藥，包括抑菌作用的漱口水有時也會選用，如洗必泰、西帕依固齦液，都可以選用來治療口腔潰瘍。阿莫西林屬于抗生素，一般在口腔感染的情況下才能選用。一般的感染性口炎，特別是細菌感染性口炎，有時會選用阿莫西林來治療，還有牙齦的炎癥，并且在有細菌感染非常明確的情況下，才能夠選用阿莫西林治療。同時抗生素，一定是在醫生的指導下才能使用。在臨床上如果患者沒有細菌感染的證據，通常不允許隨便使用抗生素。因為濫用抗生素會給患者的菌群帶來很大的變化，比如腸道菌群在口服抗生素之后，會發生很大的變化，有時很難完全恢復。