雌激素分泌不足的治療主要取決于病因，通常需要對因治療，具體如下：1、雌激素水平低于多少就是不足，其實不一定，女性在整個生命周期中，有些階段雌激素本身就應該是低的。比如在青春發育期前和更年期絕經以后，這兩個時間段的雌激素水平本來就應該低的，此時千萬不要去額外補充雌激素，這是生理性降低；2、針對育齡期的女性，如果雌激素水平低就要找相應的原因，有可能就是雌激素產生減少。雌激素的產生通常是聽命于垂體，此時要了解垂體功能，如果垂體的激素水平也低，就提示是由于垂體的原因導致女性雌激素水平減低；3、基因或者染色體異常的原因導致女性本身卵巢的功能障礙，產生雌激素減少，可以通過查找激素或者做染色體的檢查而發現。